La laptop sau la PC?
mSATA e mai scump decât SATA. În plus în caz de avarie un SATA îl scoți și îl citești oriunde.
Slotul mSATA, dacă este de fapt un mini PCI express, poate fi folosit la alte chestii, gen wifi, bluetooth, 3G, external GPU

, etc. Dacă decizi că nu e cazul sau ai destul porturi mPCIe, atunci poți pune un mSATA ca să păstrezi unitatea optică.